香港特區政府4月18日宣布將對印度、巴基斯坦及菲律賓實施地區性航班熔斷機制，從4月20日0時起禁止所有從上述地區來港的民航客機著陸香港，為期14天。同時，將這些地區列為《預防及控制疾病(規管跨境交通工具及到港者)規例》(第599H章)下的極高風險A組指明地區，限制曾在這些地區逗留人士登機來港。

　　特區政府在4月14日開始實施經收緊的個別航班熔斷機制，并同時實施新設并行的地區性航班熔斷機制。在地區性航班熔斷機制下，從同一地區抵港的所有民航客機，不論任何航空公司，如在7天內共有5名或以上乘客經抵港檢測確診并帶有N501Y變種病毒株，政府將引用第599H章禁止所有從該地區來港的民航客機著陸香港14天，同時亦會將相關地區列為第599H章下的極高風險地區，禁止曾逗留于該地區超過兩小時的人士登上任何來港的民航客機，為期14天，以避免相關地區人士經轉機到港。

　　特區政府發言人表示，由于香港首次在社區發現涉及新冠病毒N501Y變種病毒株的確診病例，為審慎起見，特區政府按剛落實的地區性航班熔斷機制所設的指標，追溯過去14天從不同地區經抵港檢測而確診帶有N501Y變種病毒株的輸入個案。印度、巴基斯坦及菲律賓均涉曾經在過去14天期間有累計7天相關個案數目觸及相關指標，因此政府將對這三個地區實施地區性熔斷機制。